首先，医疗器械被分为三个类别，其中经营第二类医疗器械不需要办理经营许可证，只需要备案凭证。而开办第三类医疗企业经营企业，应当经过相关监督管理部门审查批准，发放经营许可证，许可证有效期限为五年。

办理二类医疗器械备案凭证的具体流程：

1.到工商局办理营业执照，注册为企业，个体工商户不可以办理备案凭证。

2.到质监局办理组织机构代码证。

3.在国家食品药品监督管理总局网站上用组织机构代码注册帐号，用于网上申报。

4.网上提交《医疗器械备案申请表》所需的电子材料。

三类医疗器械经营许可证办理流程如下：

1.准备好需要的办理资料：

（1）《医疗器械经营企业许可申请表》；

（2）资格证明；

（3）营业执照或企业名称预先核准证明文件复印件；

（4）质量管理人的资格证明；

（5）售后服务人员的资格证明。

2.需要办理许可证的企业经办人携带以上资料前往所在地的市级人民***食品监督管理部门申请经营许可；

3.管理部门受理资料，于30个工作日内进行审查，必要时组织核查；

4.若符合条件，则管理部门发放医疗器械经验许可证，若不符合条件，则管理部门不予许可并通过书面的方式说明理由。