上海公司申请进出口权的流程如下：

一、确认经营范围

检查营业执照：确保营业执照经营范围中包含“货物进出口”、“技术进出口”或“代理进出口”等相关内容。

变更经营范围（如需要）：若营业执照未包含上述内容，需先到上海市市场监督管理局（或线上通过“一窗通”平台）办理经营范围变更手续，提交营业执照副本复印件、法定代表人身份证复印件、公司章程修正案等材料。

二、对外贸易经营者备案登记

在线填写备案登记表：登录商务部业务系统统一平台，进入对外贸易经营者备案登记模块，填写企业相关信息，提交后打印《对外贸易经营者备案登记表》。

现场提交材料：携带打印好的备案登记表（加盖企业公章）、营业执照副本原件及复印件（加盖公章）、法定代表人身份证复印件（加盖公章）等材料，前往上海市商务委员会指定的办事地点进行现场审核。

领取备案登记表：审核通过后，领取加盖备案登记印章的《对外贸易经营者备案登记表》。

三、海关注册登记

在线申请海关编码：登录“中国国际贸易单一窗口”或“互联网+海关”一体化网上办事平台，填写《报关单位备案信息表》，提交企业基本信息、报关人员信息等内容。

预约现场办理：在系统中预约现场办理时间。

现场提交材料：按预约时间携带营业执照副本原件及复印件（加盖公章）、法定代表人身份证复印件（加盖公章）、《对外贸易经营者备案登记表》原件及复印件（加盖公章）等材料，前往海关业务受理点。

领取海关注册登记证书：审核通过后，领取海关注册登记证书，获得十位企业海关编码。

四、电子口岸备案

在线预约：登录中国电子口岸上海分中心预约办理电子口岸卡。

提交材料：携带营业执照、对外贸易备案表、海关备案证明等原件及复印件（均需加盖公章），前往上海电子口岸制卡中心办理法人卡、操作员卡及设备。

领取电子口岸卡：审核通过后，领取法人卡和操作员卡。

五、外汇管理局登记

办理名录登记：填写《货物贸易外汇收支企业名录登记申请书》和《货物贸易外汇收支业务办理确认书》，提交至外汇管理局进行审核。

开立外汇账户：审核通过后，企业完成外汇管理局备案，具备外汇收付的资格。可携带相关材料到银行开立外汇账户。

六、其他特定商品备案（如涉及）

涉及食品、化妆品、医疗器械等特定商品进出口的企业，需到出入境检验检疫局办理备案登记手续，提交相关材料并领取备案登记证明。

七、税务登记（出口退税）

申请一般纳税人资格：向税务机关申请一般纳税人资格，以享受出口退税政策。

办理出口退税备案：登录上海市电子税务局，进入“出口退（免）税管理”模块，填写《出口退（免）税备案表》，提交后等待税务局审核。

八、办理时限与费用

办理时限：整个流程大约需要2-3周，具体时间取决于各个环节的办理效率和申请材料的准备情况。

费用：申请进出口权本身免费，但电子口岸IC卡及读卡器需支付工本费（约500元内）。若选择代理公司办理，需支付代理服务费（一般1500元左右）。

注意事项

材料准备：提前准备好所有申请材料，确保信息准确无误，以加快办理进度。

政策变化：密切关注相关政策的变化，以便及时调整办理策略。

长期规划：没有进出口权的公司可以通过委托代理方式出口，但若计划长期发展国际市场，建议尽早申请自己的进出口权，以便更好地把控贸易主动权。