您好：

1. 准备申请材料：包括公司营业执照副本复印件、法定代表人或负责人***明、食品安全管理制度文件、经营场所使用证明、食品经营许可申请书等。

2. 在线提交申请：通过深圳市市场监督管理局官方网站或相关服务平台进行在线申请，填写食品经营许可申请表，并上传相关材料。

3. 现场核查：提交申请后，市场监督管理部门将安排工作人员对申请单位的经营场所进行现场核查，确保场所符合食品安全标准。

4. 审核与批准：根据现场核查结果和提交的材料，相关部门将进行审核。审核通过后，会发放食品经营许可证。

5. 领取许可证：在审核通过后，按照通知要求前往指定地点领取食品经营许可证。

以上就是关于深圳公司注册后如何申请食品经营许可证相关步骤，希望能帮到您。