土地增值税的扣除项目金额可以按照以下方式计算：

1. 取得土地的成本：包括土地购买价款、土地整理费用、征地拆迁补偿费用等。

2. 增值收入：指土地出售或者转让所得的收入。

3. 增值额：增值收入减去土地的成本。

4. 应纳税额：增值额乘以适用税率。

5. 扣除项目金额：指纳税人在计算应纳税额时可以扣除的相关支出，包括土地增值税应纳税额中的土地增值补偿费用、房屋拆迁安置补偿费用、建设用地等级差价款等。

6. 实际应纳税额：应纳税额减去扣除项目金额后的金额。