长期零申报的公司存在一定的风险，因为这可能表明公司没有按照法律规定履行报税和报告义务。如果公司已经连续三年没有申报，建议公司尽快考虑注销，以避免可能的罚款和其他法律后果。

注销公司需要一定的程序和文件，需要向税务、工商等部门提交申请，并缴纳相关费用。在注销之前，公司需要确保没有未完成的业务和财务事项，以及清理所有的财务记录和账户。此外，公司还需要通知所有的股东和债权人，并解决可能的纠纷。

在长期零申报的情况下，公司可能会面临以下风险：

1.罚款：税务部门可能会对公司进行罚款，因为公司没有按时申报和缴纳税款。

2.信用记录受损：长期零申报可能会导致公司的信用记录受损，这可能会影响公司的未来发展和融资。

3.税务调查：税务部门可能会对公司进行税务调查，以查明公司是否存在逃税或其他违法行为。

4.法律诉讼：如果公司没有按照法律规定履行报税和报告义务，可能会面临法律诉讼。

因此，长期零申报的公司应该尽快采取行动，注销公司以避免可能的法律后果。在注销之前，公司需要仔细考虑并咨询专业人士的意见，以确保注销程序的合法性和有效性。