在上海注册一家公司并申请商标注册，需要准备相应的材料并遵循一定的流程。以下是详细的步骤和所需材料：

一、上海公司申请商标注册所需材料：

1. 《商标注册申请书》：每一件商标注册申请应当提交申请书1份，以纸质方式提出的，应当打字或者印刷。

申请人身份证明文件复印件：申请人为法人或其他组织的，应提交营业执照等有效证件的复印件;申请人为自然人的，应提交身份证、护照等有效证件的复印件。

3. 商标图样：每一件商标注册申请应当提交1份商标图样。图样必须清晰，长和宽应当不大于10厘米，不小于5厘米。

4. 委托商标代理机构办理的，应当提交《商标代理委托书》。

5. 要求优先权的，应当提交书面声明，并同时提交或在申请之日起三个月内提交优先权证明文件。

6. 申请人提交的各种证件、证明文件和证据材料是外文的，应当附送中文译文。

二、上海公司申请商标注册流程：

1. 商标名称检索：确保商标名称没有被注册过。

2. 提交申请：向国家知识产权局商标局提交商标注册申请。

3. 形式审查：商标局对申请文件进行形式审查。

4. 实质审查：对商标进行实质审查，确定是否符合注册要求。

5. 商标公告：通过实质审查的商标将被公告，供公众查阅。

6. 注册证书：公告期满无异议的，颁发商标注册证书。

三、上海市商标注册申请快速审查办事服务指南：

• 受理主体：上海市知识产权局负责审核工作。

• 申请主体：本市注册、登记的法人或其他组织以及个体工商户。

• 适用情形：包括国家或省级重大工程、重大项目、重大科技基础设施、重大赛事、重大展会等名称，且商标保护具有紧迫性的。

• 前提条件：已采用电子申请方式向国家知识产权局商标局提出商标注册申请，且符合相关条件。

• 申请材料：包括商标注册申请快速审查请求书、商标注册申请受理通知书复印件、符合适用情形的证明材料等。

• 审核流程：上海市知识产权局在收到申请材料后，5个工作日内完成审核工作。