一、公司股权变更需要缴纳哪些税款

1、企业所得税。企业在一般的股权，包括转让股票或股份的买卖中，应按有关规定执行。股权转让人应分享的被投资方累计未分配利润，或累计盈余公积金应确认为股权转让所得，不得确认为股息性质的所得。

2、个人所得税。在公司股权转让过程中，获得收益的是个人的话，要按20%的税率缴纳个人所得税。

3、印花税。企业经营过程中，涉及到股份转让的，需要按照规定交易印花税。

4、契税。根据规定，在股权转让中，单位、个人承受企业股权，企业的土地、房屋权属不发生转移，不征契税；在增资扩股中，对以土地、房屋权属作价入股或作为出资投入企业的，征收契税。

二、如何变更公司股权

1、申请人持相关材料向市政务服务中心工商局窗口提出申请，经受理审查员初审通过，开具《受理通知书》或者《申请材料接收单》。

2、不符合受理条件的，当场或者5个工作日内一次性告知申请人应当补正的全部材料并出具告知单。

3、工商局对申请人申请材料齐全、符合法定形式的，当场做出是否准予登记的决定并出具《登记决定通知书》。

4、需要对申请材料的实质内容进行核实的，出具《企业登记材料需要核实事项告知书》，工商管理局必须在10个工作日内作出核准或者驳回申请的决定。

5、工商管理局必须在10个工作日内作出核准或者驳回申请的决定。工商行政管理局在5个工作日后，申请人可以凭《登记决定通知书》到发照窗口换发《准予变更登记通知书》。

法律规定：

《公司法》第三十二条：公司应当将股东的姓名或者名称向公司登记机关登记；登记事项发生变更的，应当办理变更登记。未经登记或者变更登记的，不得对抗第三人。