股份转让协议的注意事项主要是：

1、明晰股权结构，应就被转让公司的股权结构作详尽了解；

2、进行评估，确认转让的份额后，应请国家认可的资产评估所对被收购公司的资产及权益进行评估，出具评估报告；

3、确定股权转让总价款；

4、保证出让方主体资格合法，转让股权有关的活动中所提及的文件均合法有效，没有损害他人利益等。

《公司法》第一百三十七条规定，股东持有的股份可以依法转让。

第一百三十八条规定，股东转让其股份，应当在依法设立的证券交易场所进行或者按照国务院规定的其他方式进行。