税务局一般会重点查询以下几个方面：

1、查合同

被选中稽查的企业，税务局会先根据企业的实际经营范围，查看该企业的合同是否经济内容是否合规，检查收否有存在不合理的交易情况。

2、查*****

查看票据的开具是否在范围内，企业虚假开具*****的后果是很严重的，一旦被查出来，除了补缴税款，更严重的可能要承担责任。

3、查账簿

查询合作双方的账簿，看购买方和销售方的同一项经济业务的交易入账内容是否一致；根据规定，虚假支付结算的，或者是出现非法公转私等情况的会严惩。还有要特别提醒一点，双方的银行卡以及现金的流向是要有真实现金流的，一定要保证*****、业务、资金这三项内容的流向是一致的，它们的真实流向是一条完整的证据链，不然的话还是有可能会被认为存在问题。

4、税务异常

如果企业的税负出现浮动异常，上下浮动超过一定范围值的，税务机关就会对其进行重点调查。在税收上享受优惠政策的企业，具体的税收情况也是清查的重点。