在崇明区注册公司的优惠政策如下：

一、高额返税税收政策

崇明区是上海诸多开发区之中，唯一享受海岛政策的区域。在崇明区注册公司的优惠力度最大就是税收。市***对崇明地区的创业者们扶持力度很大—其体现就是给企业返税，这在上海其他地区几乎是罕见的，甚至是不存在的。在上海崇明区，上海注册公司不仅没有限额的缴税制度，甚至达到缴税就返营业税的20%，而返税也比较便利，主要通过转账到纳税账户或者是公司的基本上账户中。

二、大力返企业所得税的优惠政策

上海崇明区拥有100%上海市***保留的企业所得税。这是完全不同于其他地区的，在其他地区，地方只保留40%的企业所得税。而对于上海注册公司而言，一般能获得所缴纳的企业所得税的16%到18%，而具体到金额就是一笔不少的政策补贴。

三、增值税

国家规定，需要上缴75%企业的增值税，而对于仅剩的25%企业上缴的增值税，市***也毫无保留的用于崇明岛的建设中。而其中用于留给在上海崇明岛注册的公司的增值返税就高达7%至9%。

由此，我们可以看出在上海崇明区注册公司的优惠政策是其他区所不能比的，所以准备在上海注册公司的创业者们可以考虑在崇明区发展。