公司股权变更涉及的税种主要包括企业所得税、个人所得税、印花税，特殊情况下可能涉及土地增值税。具体适用情况如下：

一、企业所得税（适用企业股东）

-征税对象：企业股东转让股权取得的收益。

-税率：25%（一般企业）或优惠税率（如高新技术企业15%）。

-计税依据：

应纳税所得额=股权转让收入-股权原值-合理费用

（合理费用包括评估费、中介服务费等与转让直接相关的支出）。

-特殊处理：

-符合条件的股权收购可适用特殊性税务处理（递延纳税）。

二、个人所得税（适用个人股东）

-征税对象：个人股东转让股权取得的收益。

-税率：20%（财产转让所得）。

-计税依据：

应纳税所得额=股权转让收入-股权原值-合理费用

-若申报收入明显偏低且无正当理由，税务机关可核定收入。

-特殊情况：

-转让上市公司股票暂免个人所得税（限流通股）；

-非上市公司股权转让需主动申报。

三、印花税

-征税对象：股权转让书据（合同/协议）。

-税率：

-产权转移书据：（双方缴纳，目前可能享受减半征收优惠）；

-证券交易印花税：仅限上市公司股票（单边，受让方不缴）。

-计税依据：合同所载金额（若金额不明确，按市场价或核定值）。

四、土地增值税（特殊情形）

若股权转让实质为不动产转移（如公司主要资产为土地/房产），税务机关可能穿透认定，要求按土地增值税纳税（税率30%-60%）。

-常见场景：通过转让公司100%股权间接转让房地产。

注意事项

1.纳税义务发生时间：合同生效或款项支付时（以先为准）。

2.申报要求：

-企业所得税/个人所得税需在变更后15日内申报；

-印花税通常与合同签订同步缴纳。

3.税务筹划空间：

-合理定价（避免核定）；

-利用特殊性税务处理（如企业重组）；

-区分股权转让与资产转让（税负差异大）。